6月7日、平成28年度全国高校総体「2016 情熱疾走 中国総体」サッカー競技の代表校が新たに佐賀と熊本で決定した。佐賀予選では佐賀東が延長前半7分、FW川内陽一のゴールで勝ち越しに成功し2-1で佐賀学園を下し2年ぶり12回目の全国総体出場を決めた。大津が準決勝で敗退した熊本予選は熊本国府がFW杉田達哉の決勝弾で大津撃破の熊本商を下し全国への切符を手にした。

　各都道府県の出場校決定日及び代表校は以下の通り。

▽北海道・東北
北海道2:6月17日
青森:青森山田（17年連続20回目）
岩手:盛岡商（3年連続24回目）
宮城:仙台育英（2年ぶり17回目）
秋田:秋田商（2年連続32回目）
山形:山形中央（3年ぶり10回目）
福島:尚志（7年連続9回目）

▽関東
茨城:6月22日
栃木:6月19日
群馬:6月19日
埼玉2:6月19日
千葉2:6月19日
東京2:6月18日
神奈川2:6月18日
山梨:6月19日

▽東海・北信越
新潟:帝京長岡（4年ぶり5回目）
長野:市立長野（初出場）
富山:高岡第一（2年ぶり3回目）
石川:星稜（5年連続25回目）
福井:福井工大福井（2年ぶり2回目）
静岡:静岡学園（3年ぶり5回目）
愛知1:刈谷（5年ぶり8回目）
愛知2:中京大中京（4年連続19回目）
岐阜:帝京大可児（2年ぶり4回目）
三重:三重（3年ぶり3回目）

▽関西
滋賀:綾羽（初出場）
京都:京都橘（2年ぶり3回目）
大阪1:大阪学院高（初出場）
大阪2:履正社（2年連続3回目）
兵庫:滝川第二（2年連続23回目）
奈良:一条（4年ぶり6回目）
和歌山:近大和歌山（4年ぶり11回目）

▽中国・四国
鳥取:米子北（9年連続12回目）
島根:立正大淞南（9年連続11回目）
岡山:6月12日
広島2:6月11日
山口:6月12日
香川:6月11日
徳島:徳島市立（3年連続15回目）
愛媛:6月11日
高知:高知商（2年ぶり7回目）

▽九州
福岡:東福岡（5年連続14回目）
佐賀:佐賀東（2年ぶり12回目）
長崎:6月10日
熊本:熊本国府（15年ぶり3回目）
大分:中津東（7年ぶり2回目）
宮崎:日章学園（3年ぶり12回目）
鹿児島:鹿児島城西（3年ぶり6回目）
沖縄:那覇西（3年ぶり14回目）