7月29日、平成28年度全国高校総体「2016情熱疾走中国総体」サッカー競技の3回戦が開催され、市立船橋（千葉2）、青森山田（青森）、流通経済大柏（千葉1)の高校年代最高峰リーグ、プレミアリーグ勢の3校や史上初のインターハイ3連覇を目指した東福岡（福岡）を2回戦で下した昌平（埼玉1）らが8強に進出した。
前回大会準優勝の市立船橋はDF原輝綺とFW村上弘有のゴールで2-0で鹿児島城西（鹿児島）に勝利し8強入りを決めた。青森山田は得点ランキングトップに並ぶ6得点目となるFW鳴海彰人のゴールによって1-0で鹿島学園（茨城）に勝利し3回戦を突破。流通経済大柏はスコアレスのまま突入したPK戦の末に日本航空（山梨）に勝利し次戦に駒を進めている。
また、2回戦で大金星を挙げた昌平は後半アディショナルタイムにFW本間椋の3戦連発となるゴールで同点に追いつくと、その後突入したPK戦を制し8強入りを決めた。開催県代表の瀬戸内（広島）は前回大会8強の滝川第二（兵庫）と対戦し4-0の快勝で初の8強入り。そして、ここまで危なげなく勝ち上がってきた静岡学園（静岡）は初出場の大阪学院大高（大阪1）と対戦し、2-0で勝利した。
3回戦の試合結果は以下の通り。尚、続く準々決勝は31日に行われる。
3回戦
| 日程 | 会場 | 対戦カード | |||
|---|---|---|---|---|---|
| 2016.07.29 10:00 | エディオンスタジアム広島 | 昌平(埼玉1） | 1 - 1PK 4 - 3 試合終了 | 前橋商（群馬） |  |
| 2016.07.29 10:00 | 呉市総合スポーツセンター多目的グラウンド | 静岡学園（静岡） | 2 - 0 試合終了 | 大阪学院大高（大阪1） | |
| 2016.07.29 10:00 | 広島広域公園補助競技場 | 滝川第二（兵庫） | 0 - 4 試合終了 | 瀬戸内（広島） | |
| 2016.07.29 10:00 | 呉市総合スポーツセンター陸上競技場 | 鹿児島城西（鹿児島） | 0 - 2 試合終了 | 市立船橋（千葉2） | |
| 2016.07.29 12:00 | 呉市総合スポーツセンター多目的グラウンド | 青森山田（青森） | 1 - 0 試合終了 | 鹿島学園（茨城） | |
| 2016.07.29 12:00 | 広島広域公園補助競技場 | 星稜（石川） | 1 - 1PK 3 - 4 試合終了 | 米子北（鳥取） | |
| 2016.07.29 12:00 | エディオンスタジアム広島 | 履正社（大阪） | 1 - 1PK 4 - 2 試合終了 | 日章学園（宮崎） | |
| 2016.07.29 12:00 | 呉市総合スポーツセンター陸上競技場 | 日本航空（山梨） | 0 - 0PK 3 - 4 試合終了 | 流通経済大柏（千葉1） | |
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