3年ぶりの全国総体出場となった福井商、愛知県第1代表の東海学園(愛知1)、13年ぶりの全国となった中京(岐阜)、初出場の伊賀白鳳(三重2)は1回戦敗退。サッカー王国・静岡を制した藤枝東は初戦で神村学園(鹿児島)を下すも次戦でPK戦の末に惜しくも明秀日立(茨城)に敗れた。刈谷(愛知2)は16本のシュートを浴びせ初戦では西目(秋田)に5-0で勝利するも2回戦で2012年度覇者の三浦学苑(神奈川1)に1-2で敗北。開催県第1代表の三重(三重)は初戦となった2回戦で日章学園(宮崎）に完封負けを喫し地元開催の全国総体で白星を挙げることが出来なかった。

▽出場校一覧
新潟予選：新潟明訓(3年ぶり7回目)・・・1回戦
長野予選：松本国際(3年ぶり2度目)・・・1回戦
富山予選：富山第一(2年連続27回目)・・・8強
石川予選：星稜(7年連続27回目)・・・2回戦
福井予選：福井商(3年ぶり2回目)・・・1回戦
静岡予選：藤枝東(11年ぶり13回目)・・・2回戦
愛知予選：東海学園(3年ぶり5回目)・・・1回戦
愛知予選：刈谷(2年ぶり9回目)・・・2回戦
岐阜予選：中京(13年ぶり3回目)・・・1回戦
三重予選：三重(3年連続5回目)・・・2回戦
三重予選：伊賀白鳳(初出場)・・・1回戦