2020シーズンも高円宮杯 JFA U-18サッカープリンスリーグは全国9地域でのリーグ戦を実施する。プリンスリーグ北海道は8チーム構成、その他8地域は10チームが優勝と高円宮杯 JFA U-18サッカープレミアリーグ 2020 プレーオフ進出(※プレーオフ出場枠は以下の通り)を目指して熱戦を展開する。各地域のプリンスリーグ出場チームは以下の通り※()内は前回大会順位。

▽プリンスリーグ北海道
北海道コンサドーレ札幌U-18(1位)
旭川実(2位)
札幌第一(3位)
駒大苫小牧(4位)
札幌大谷(5位)
札幌創成(6位)
東海大札幌(昇格)
北海道大谷室蘭(昇格)

▽プリンスリーグ東北
尚志(福島 / 降格）
青森山田セカンド(青森 / 1位）
モンテディオ山形ユース(山形 / 2位）
ベガルタ仙台ユース(宮城 / 3位）
仙台育英(宮城 / 4位）
盛岡商(岩手 / 6位）
遠野(岩手 / 7位）
聖光学院(福島 / 8位）
聖和学園(宮城 / 昇格）
帝京安積(福島 / 昇格）

▽プリンスリーグ関東
鹿島アントラーズユース(茨城 / 降格)
三菱養和SCユース(東京 / 4位)
前橋育英(群馬 / 5位)
川崎フロンターレU-18(神奈川 / 6位)
東京ヴェルディユース(東京 / 7位)
帝京(東京 / 8位)
桐生第一(群馬 / 9位)
矢板中央(栃木 / 10位)
山梨学院高等学校(山梨 / 昇格)
昌平(埼玉 / 昇格)

▽プリンスリーグ北信越
帝京長岡(新潟 / 1位)
富山第一(富山 / 2位)
丸岡(福井 / 3位)
アルビレックス新潟U-18(新潟 / 4位）
北越(新潟 / 5位)
星稜(石川 / 6位)
新潟明訓(新潟 / 7位)
カターレ富山U-18(富山 / 8位）
松本山雅FC U-18(長野 / 昇格)
ツエーゲン金沢U-18(石川 / 昇格)

▽プリンスリーグ東海
JFAアカデミー福島U-18(静岡 / 1位)
静岡学園(静岡 / 2位)
清水桜が丘(静岡 / 3位)
藤枝東(静岡 / 4位）
帝京大可児(岐阜 / 5位)
浜松開誠館(静岡 / 6位)
富士市立(静岡 / 7位)
藤枝明誠(静岡 / 8位）
常葉橘(静岡 / 昇格)
四日市中央工(三重 / 昇格)

▽プリンスリーグ関西
阪南大高(大阪 / 1位)
京都橘(京都 / 2位)
東海大仰星(大阪 / 3位)
興國(大阪 / 4位）
金光大阪(大阪 / 5位)
三田学園(兵庫 / 6位)
大阪桐蔭(大阪 / 7位)
履正社(大阪 / 昇格）
大阪産大附(大阪 / 昇格)
初芝橋本(和歌山 / 昇格)

▽プリンスリーグ中国
岡山学芸館(岡山 / 1位)
米子北(鳥取 / 2位)
作陽(岡山 / 3位)
立正大淞南(島根 / 4位）
ファジアーノ岡山U-18(岡山 / 5位)
広島皆実(広島 / 6位)
瀬戸内(広島 / 7位)
就実(岡山 / 8位）
玉野光南(岡山 / 昇格)
ガイナーレ鳥取U-18(鳥取 / 昇格)

▽プリンスリーグ四国
愛媛FC U-18(愛媛 / 降格)
徳島ヴォルティスユース(徳島 / 1位)
徳島市立(徳島 / 2位)
今治東中等教育学校(愛媛 / 3位）
カマタマーレ讃岐U-18(香川 / 4位)
大手前高松(香川 / 5位)
高知中央(高知 / 6位)
四国学院大学香川西(香川 / 7位）
高知(高知 / 昇格)
尽誠学園(香川 / 昇格)

▽プリンスリーグ九州
アビスパ福岡 U-18(福岡 / 降格)
大分トリニータU-18(大分 / 2位)
九州国際大付(福岡 / 3位)
日章学園(宮崎 / 4位）
神村学園(鹿児島 / 5位)
ロアッソ熊本U-18(熊本 / 6位)
V・ファーレン長崎U-18(長崎 / 7位)
筑陽学園(福岡 / 8位）
サガン鳥栖U-18 2nd(佐賀 / 昇格)
国見(長崎 / 昇格)

【プレーオフ出場枠】
北海道：1　東北：2　関東：3　北信越：2　東海：2　関西：1　中国：2　四国：1　九州：2