第100回全国高校サッカー選手権予選が九州・沖縄地区でも10月30、31日に開催される。

　福岡では30、31日の両日で大会2連覇を狙う高円宮杯 JFA U−18サッカープレミアリーグ2021 WEST所属の東福岡、令和3年度全国高校サッカーインターハイ（総体）16強の飯塚、高円宮杯 JFA U−18サッカープリンスリーグ2021九州所属で第99回全国高校サッカー選手権福岡予選準優勝の九州国際大付、前回大会4強でプリンスリーグ2021九州で戦う筑陽学園、全国選手権出場回数14回を誇る東海大福岡(東海大五)などが準々決勝に挑む。

　佐賀では31日に準決勝、佐賀東対龍谷、鳥栖対佐賀商を開催する。大分、宮崎予選は30日に準々決勝が実施。また、熊本でも30、31日に準々決勝が行われ高円宮杯 JFA U−18サッカープレミアリーグ2021 WEST所属で令和3年度全国高校サッカーインターハイ（総体）出場校の大津、2大会連続での全国を目指すルーテル学院、2年ぶりの優勝を目指す熊本国府、今年のインターハイ熊本予選準優勝の秀岳館、4年ぶりの王座奪還を狙う東海大熊本星翔など8強が激突する。長崎では30日に3回戦が実施され、鹿児島では県大会が30日に開幕を迎える。

　出場校決定日は以下の通り。(※開催日は現時点のもの)