夏の全国総体を懸けた平成28年度高校サッカーインターハイの出場校が6月19日までに54校が決定。残すは茨城の1代表のみとなった。茨城は22日に「鹿島学園vs水戸啓明」の決勝戦が開催され出場校が決定する。

　ここまでに全国3連覇を狙う東福岡（福岡）や前回大会準優勝の市立船橋、同4強の関東一（東京1）、そして全国常連の青森山田（青森）、星稜（石川）らが出場権を獲得している。初出場は北照（北海道2）、慶應義塾（神奈川2）ら計7校。その一方で、昨年度の選手権全国準優勝の國學院久我山（東京2）や同8強の前橋育英（群馬）、さらに大津（熊本）、作陽（岡山）、桐光学園、日大藤沢（神奈川）ら強豪校が予選で敗退し全国出場を逃している。

　各都道府県の出場校の顔触れは以下の通り。尚、広島で開催される全国総体の開幕は7月27日。