冬の高校日本一を決める「第95回全国高校サッカー選手権」への出場を懸けた新潟予選2回戦が8月28日に各会場で行われた。

　日本文理と直江津中等教育学校の一戦は日本文理が17-0で大勝。長岡大手と高田商の一戦は前半は0-0で終えるも後半に両校点を取り合い4-3で長岡大手が勝利し2回戦を突破した。初戦では吉田から15点を奪った村上桜ヶ丘は先制点を奪うも新潟南に逆転負けを喫し2回戦敗退。また、長岡と村松の一戦は7-0で長岡に軍配。十日町総合と新発田の対戦は11-0で新発田が勝利している。さらに、敬和学園は新潟産大附に1-0で勝利し次戦に駒を進めた。

　尚、続く3回戦には前回大会優勝校の新潟明訓や今夏の全国総体出場校の帝京長岡らが登場。新潟明訓は長岡大手と帝京長岡は新潟江南との初戦に臨む。2回戦の試合結果は以下の通り。

2回戦

日程	対戦カード
2016.08.28	新発田中央	1 - 7 試合終了	新潟江南	(0)
2016.08.28	長岡	7 - 0 試合終了	村松	(0)
2016.08.28	村上桜ヶ丘	1 - 3 試合終了	新潟南	(0)
2016.08.28	新潟	3 - 0 試合終了	五泉	(0)
2016.08.28	村上中等	0 - 5 試合終了	中越	(0)
2016.08.28	新潟北	1 - 0 試合終了	開志国際	(0)
2016.08.28	十日町総合	0 - 11 試合終了	新発田	(0)
2016.08.28	新津南	0 - 1 試合終了	新発田南	(0)
2016.08.28	分水	0 - 9 試合終了	加茂暁星	(0)
2016.08.28	新潟商	8 - 1 試合終了	村上	(0)
2016.08.28	長岡商	0 - 1 試合終了	加茂	(0)
2016.08.28	高田商	3 - 1 試合終了	長岡大手	(0)
2016.08.28	長岡工	2 - 1 試合終了	新井	(0)
2016.08.28	関根学園	0 - 1 試合終了	高田	(0)
2016.08.28	日本文理	17 - 0 試合終了	直江津中等	(0)
2016.08.28	糸魚川	1 - 0 試合終了	三条東	(0)
2016.08.28	新潟向陽	1 - 2 試合終了	豊栄	(0)
2016.08.28	見附	0 - 6 試合終了	新津	(0)
2016.08.28	東京学館新潟	10 - 0 試合終了	小千谷	(0)
2016.08.28	敬和学園	1 - 0 試合終了	新潟産大附	(0)
2016.08.28	三条	1 - 0 試合終了	巻	(0)
2016.08.28	柏崎	4 - 1 試合終了	万代	(0)
2016.08.28	十日町	6 - 0 試合終了	阿賀黎明	(0)
2016.08.28	上越総合技術	7 - 0 試合終了	佐渡	(0)