4月21日、アジアサッカー連盟(AFC)は、マレーシアのクアラルンプールでAFC U-16選手権2018の予選の組み合わせ抽選会を実施し、日本はマレーシア、シンガポール、グアムとグループIで戦うことが決定した。グループの組み合わせは以下の通り。
▽グループA
ウズベキスタン、サウジアラビア(H)、ヨルダン、バーレーン、スリランカ
▽グループB
オマーン、タジキスタン(H)、シリア、トルクメニスタン、モルディブ
▽グループC
イラン(H)、キルギス、アフガニスタン、レバノン、ブータン
▽グループD
イラク、インド、パレスチナ、ネパール(H)
▽グループE
アラブ首長国連邦、イエメン、カタール(H)、バングラデシュ
▽グループF
朝鮮民主主義人民共和国、香港、チャイニーズ・タイペイ、マカオ、ブルネイ
▽グループG
タイ(H)、ラオス、東ティモール、北マリアナ諸島、インドネシア
▽グループH
韓国、中国、ミャンマー、フィリピン
▽グループI
ベトナム、オーストラリア、モンゴル(H)、カンボジア
▽グループJ
日本、マレーシア、シンガポール、グアム