第98回全国高校サッカー選手権熊本予選の2回戦20試合が10月12、13日に行われる。

　翔陽と熊本西は秀岳館への挑戦権をかけて激突。共に今大会初戦となる宇土と松橋の勝者は次戦で熊本国府と戦う。済々黌は球磨工と、八代農は熊本と3回戦進出をかけて戦う。

　続く19日と20日の両日で行われる3回戦からは秀岳館、熊本国府、開新、熊本商が登場。大津、熊本学園大付、東海大熊本星翔、ルーテル学院は26日と27日で行われる4回戦からの登場となっている。なお、決勝は11月16日に水前寺競技場で開催される。