第99回全国高校サッカー選手権大会愛媛県大会組み合わせ抽選会が南海放送で行われ、対戦カードが決まった。今年度は新型コロナウイルスの影響により、従来の地区予選を取りやめ出場42校による県下一斉トーナメントを実施する。

　第1シードは大会連覇を狙う令和元年度愛媛新人戦（新人選手権大会）優勝の今治東中等教育学校、第2シードは同準優勝の今治西。第3シードは同3位の松山北、第4シードには同4位の松山工がそれぞれ入った。大会は8月18日に開幕する。